Il virus SARS-CoV-2, responsabile della pandemia di COVID-19, è un coronavirus a RNA appartenente alla famiglia Coronaviridae. Identificato per la prima volta a Wuhan, Cina, alla fine del 2019, il virus ha rapidamente prodotto numerose varianti genomiche nel corso della pandemia. Queste varianti si distinguono per specifiche mutazioni, in particolare nella proteina spike, che influenzano la trasmissibilità, la virulenza e l’efficacia della risposta immunitaria.
La tabella seguente riassume le principali varianti di SARS-CoV-2 isolate fino a giugno 2025, includendo le caratteristiche genetiche chiave, l’anno e il luogo di isolamento, la diffusione epidemiologica e il grado di riconoscimento scientifico basato su dati pubblicati. Per le varianti più recenti (2024-2025), dove le evidenze sono ancora in via di consolidamento, sono riportate anche fonti da database pubblici e preprint.
Tabella 1- Varianti SARS-CoV-2 al giugno 2025
| Variante | Lineaggio Clade | Mutazioni Chiave | Regione di Origine (Anno) | Diffusione Impatto | Riconoscimento Unanime | Fonte |
| Wuhan-Hu-1 | Lineaggio A | Nessuna mutazione significativa (ceppo originario) | Wuhan, Cina (2019) | Origine pandemia | Sì | 1,2 |
| Alpha (B.1.1.7) | B.1.1.7 | N501Y, 69/70 deletion, P681H, D614G | Regno Unito (settembre 2020) | Dominante invernale 2020 | Sì | 3,4 |
| Beta (B.1.351) | B.1.351 | K417N, E484K, N501Y, D614G | Sud Africa (maggio 2020) | Epidemie regionali 2021 | Sì | 5,6 |
| Gamma (P.1) | P.1 | K417T, E484K, N501Y, D614G | Brasile (novembre 2020) | Epidemie regionali 2021 | Sì | 7,8 |
| Delta (B.1.617.2) | B.1.617.2 | L452R, T478K, P681R, D614G | India (ottobre 2020) | Dominante 2021 | Sì | 9,10 |
| Omicron BA.1 | BA.1 | >30 spike mutazioni incl. S371L, G496S, Q498R | Sud Africa/Botswana (novembre 2021) | Rapida diffusione 2021-2022 | Sì | 11,12 |
| Omicron BA.2 | BA.2 | Differenze da BA.1: S371F, T376A, D405N | Sud Africa (gennaio 2022) | Diffusione 2022 | Sì | 13,14 |
| Omicron BA.4/BA.5 | BA.4, BA.5 | L452R, F486V | Sud Africa (marzo 2022) | Dominanti in alcune regioni 2022-23 | Sì | 11 |
| BQ.1/BQ.1.1 | Linee Omicron BA.5 | K444T, N460K | Globale (inizio 2023) | Emergenti 2023 | Parzialmente | 15 |
| XBB.1.5 | Ricombinante Omicron | F486P, R346T | Globale (2023) | Emergenti 2023 | Parzialmente | 16 |
| CH.1.1 | Omicron ricombinante | L452R, F486S | Asia Sudorientale (2023) | Emergenti 2023 | Parzialmente | 17 |
| KP.2 | JN.1 derivato BA.2.86.1 | S:R346T, S:F456L, S:Q493E | Stati Uniti (2024) | Dominante USA 2024 | Parzialmente | 18,19 |
| KP.3.1.1 | Discendenza KP.3 | S:S31del | Stati Uniti (2024) | Maggiore trasmissibilità 2024 | Parzialmente | 18,19 |
| XEC | Ricombinante KS.1.1 + KP.3.3 | S:F456L, S:R346T | Francia (novembre 2024) | 40.1% casi Francia Nov 2024 | Parzialmente | 20 |
| NB.1.8.1 | Derivato XDV.1.5.1 | T22N, F59S, G184S, A435S, L455S, F456L, T478I, Q493E | Estremo Oriente (2025) | Rapida diffusione 2025 | Parzialmente | 20 |
NOTA: la tabella può essere liberamente copiata e modificata solo con citazione della fonte.
FONTE: Zucconelli I. SARS-CoV-2: varianti. 2025. www.ivanzucconelli.it
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